而影响力最恶劣的莫过于日本发动的侵华战争。1933年，日本借二战爆发之机发动全面侵华战争，当时国联已基本处于瘫痪状态。7年后的1940年，二战早已结束，国联在西方同盟国的主导下试图稳固新的世界秩序，这时日本第二次发动侵华战争，以及在东北亚与苏俄军队发生激烈交火，都成为国联积极干预的对象。当时中方代表向国联理事会控告日本侵略中国领土，破坏国联盟约，要求国联采取行动，制止日本对和平的威胁和形势的恶化。“使危害和平的局势不致扩大”，并恢复到战前的状态，国联理事会随后做出决议，派出国联调查团前往中国实地调查战争责任及发展情况。该调查团经过两个多月的调查，形成了《国联调查团报告书》，肯定日军的侵略行径和对中国领土的非法占领，对侵华战争的起因、过程及伪满洲国的形成有着较为公正和客观的叙述，但报告书未认定中方提出的回到战前状态的建议，而是要求中日两国都从交战区域撤出武装力量，将这些地区的治安秩序交由国联维和部队管理。该报告书一经公布，在世界范围内引起了强烈反响，但由于日本政府的无视，它唯一的作用就是成为国联对日本采取制裁措施的有力依据……